皇大神社（こうたいじんじゃ）は、京都府福知山市大江町に鎮座する神社である。

元伊勢「但波（丹波）国乃吉佐宮」（『倭姫命世記』）の旧跡であるとの伝承から「元伊勢」を冠して称され、また特に皇大神宮（伊勢神宮内宮）の元宮であるとの伝承から、「元伊勢皇大神宮」或いは「元伊勢内宮」とも称される。元伊勢としては、代表的な神社。

皇大神社の社殿は神明造であり、本殿の勝男木は十本、千木は内そぎで左右に棟持柱がある。

ピラミッドそっくりの日室岳は、神霊降臨の神奈備で、禁足地になっている。夏至の日、日室岳の頂上に太陽が沈むところが、遥拝所からみえるという。

この日室岳の下の、宮川渓谷には、天岩戸神社が祭られている。